[Statistics] How can you say they are different groups?

在生態領域中,我們經常會使用多變量分析來解釋一堆變數的變化趨勢。但是就像我們得到principle component analysis的eigen value & factor score之後,我們難道只能憑著主觀的判斷去說這是不同的組別嗎? 還是我們能夠應用一些統計方法來驗證不同組別之間的差異呢?

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Figure source:
Kuehne, L. M., Padgham, B. L. and Olden, J. D. (2013) The soundscapes of lakes across an urbanization gradient. PLOS one 8: e55661. doi:10.1371/journal.pone.0055661

方法千千百百種,其中一種我們可以應用的統計方法是搭配permutation method的multivariate analysis of variance (MANOVA)。在R軟體中的vegan package,有一個adonis function可以幫助我們去驗證不同組之間在多變量的空間中的中心點是否有顯著差異。不過此方法就如同ANOVA一樣,可能會受到組內的變異程度而影響,因此建議也須進行homogeneity test來了解各組之間的數值變異程度是否有差異。在vegan package中有另一個betadisper function可以幫我們去驗證不同組之間在多變量的空間中的數值變異程度的顯著差異。

以下是可以在R軟體中輸入的程式碼:

圖片3

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